1986年9月-1993年12月 在原浙江大学化工系传递教研室中分立成立了环境化工教研室，学术带头人谭天恩教授，徐根良任主任，鲍慧敏任副主任；1978年招收环境化工专业第一届硕士生,1987年招收第一届博士生，1988年招收第一届本科生。
1993年12月-1999年7月 在环境化工教研室基础上成立环境科学与工程研究所；汪大翬任所长，金一中任副所长。
1999年7月-2005年12月 更名为环境工程研究所；汪大翬任所长，吴忠标、金一中任副所长。
2005年12月-2010年1月 吴忠标任所长，金一中、徐新华任副所长。
2010年1月-2013年1月 李伟任所长， 官宝红、杨岳平任副所长。
2013年1月-2015年1月 吴忠标任所长，官宝红、杨岳平任副所长。
2015年1月-2017年1月 吴忠标任所长，官宝红、程丽华任副所长。
2017年1月：更名为环境技术研究所；吴忠标任所长，官宝红、程丽华任副所长。
2017年3月-2022年3月 吴忠标任所长，刘越、程丽华任副所长。
2022年4月-至今 吴忠标任所长，王海强、程丽华任副所长。